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Curriculum

Elena PERRIN

Ruolo attuale:: Ricercatore Legge 240/10 a tempo determinato
SSD:: BIO/18 - Genetica
Afferenza organizzativa:: Dipartimento di Biologia

Recapiti

elena.perrin(AT)unifi.it

Ulteriori Recapiti

	Dipartimento di Biologia
	Ufficio: +39 055 4574760 Laboratorio: +39 055 4574706
	elena.perrin(AT)unifi.it
	https://www.bio.unifi.it/vp-435-elena-perrin.html

Elena PERRIN

Curriculum

Elena Perrin

Curriculum vitae et studiorum

Informazioni personali

Data di nascita: 30 aprile 1984

Luogo di nascita: Montevarchi (AR), Italia

Cittadinanza: Italiana

Affiliazione: Dipartimento di Biologia, Università di Firenze, Via Madonna del Piano 6, 50143 Sesto F.no, Firenze Italy

Posizione attuale: Ricercatore Legge 240/10 a tempo determinato tipologia A, SSD: BIO/18

Istruzione e esperienze professionali

Settmbre 2022- presente: Ricercatore Legge 240/10 a tempo determinato tipologia A, SSD: BIO/18
Maggio 2015- Agosto 2022: ricercatrice Post-doc presso il Dipartimento di Biologia, Università degli studi di Firenze

Gennaio- Aprile 2015:

Vincitrice FEMS Short term fellowship, presso il laboratorio del Prof. Miguel Valvano, Centre of Infection and Immunity, Queen's University, Belfast, per un progetto relativo alla caratterizzazione del regolatore trascrizionale AtsR in Burkholderia

Gennaio- Dicembre 2014:

Vincitrice di una Borsa di studio Fondazione Adriano Buzzati Traverso, attività svolta presso il presso il dipartimento di Biologia, Laboratorio di Evoluzione Microbica e Molecolare, prof. Fani, Università di Firenze. Progetto: "Fighting Burkholderia infections through the understanding of RND proteins regulation"

Marzo 2014:

Conseguimento del titolo di dottore di ricerca in "Scienze e tecnologie vegetali, microbiologiche e genetiche" (Indirizzo "Scienze Genetiche e Microbiologiche e Bioinformatica") presso l'Università degli Studi di Firenze, con una tesi dal titolo "Fighting Burkholderia cepacia complex: exploring virulence, new antimicrobials and antibiotics resistance" (Tutor: prof. Renato Fani).

Gennaio 2011- Dicembre 2013:

Dottorato di ricerca in "Scienze e tecnologie vegetali, microbiologiche e genetiche" (Indirizzo "Scienze Genetiche e Microbiologiche e Bioinformatica"), scuola di Dottorato “Ubaldo Montelatici”, Università di Firenze.

Luglio- Dicembre 2010:

Vincitrice borsa di studio per lo svolgimento della ricerca “Caratterizzazione di comunità microbiche naturali isolate da suoli sottoposti a diverse pratiche agricole” presso il dipartimento di Biologia Evoluzionistica “Leo Pardi”, Università degli Studi di Firenze

Dicembre 2009:

Abilitazione all’esercizio della professione di biologo presso l’Università degli studi di Firenze

Votazione Finale 200/200

Ottobre- Dicembre 2009:

Contratto di collaborazione coordinata e continuativa con l’Università degli Studi di Firenze, dipartimento di Biologia Evoluzionistica “Leo Pardi”, per lo svolgimento di “Identificazione di geni di patogeni opportunisti responsabili di infezioni in pazienti affetti da Fibrosi Cistica da utilizzare come target di antibiotici prodotti da batteri antartici”

Anno accademico 2007-2008:

Laurea Specialistica in Biologia Cellulare e Molecolare con la votazione di 110/110 e lode con una tesi dal titolo:

“Analisi evolutiva e comparativa di sistemi di efflusso RND nel genere Burkholderia”

Relatore: Prof. Renato Fani

Correlatore: Dott. Marco Fondi

Settembre 2008- Aprile 2009:

Tesi di laurea presso il Dipartimento di Biologia Evoluzionistica “Leo Pardi” dell’Università degli Studi di Firenze (laboratorio Prof. Renato Fani)

Anno accademico 2006-2007

Iscrizione al corso di laurea specialistica in Biologia Cellulare e Molecolare presso l’Università degli Studi di Firenze

Anno accademico 2005-2006

Laurea triennale in Scienze Biologiche con la votazione di 110/ 110 e lode con una tesi dal titolo:

“SNuPE (Single Nucleotide Primer Extension): un nuovo metodo molecolare per l’identificazione dei batteri”

Relatore: Prof. Renato Fani

Correlatore: Dott. Alessio Mengoni

Settembre 2006- Gennaio 2007

Tirocinio e tesi di laurea presso il dipartimento di Biologia Evoluzionistica “Leo Pardi” dell’Università degli Studi di Firenze (laboratorio Prof. Renato Fani)

Anno accademico 2003-2004

Iscrizione al corso di laurea in Scienze Biologiche presso l’Università degli Studi di Firenze

Anno scolastico 2002-2003

Diploma di maturità scientifica (5 anni) conseguito presso il Liceo Scientifico e Liceo Ginnasio “Benedetto Varchi” (Montevarchi AR) con la votazione di 100

Periodi in laboratori nazionali ed internazionali

28/05/2012-22/06/2012: ospite del laboratorio della Prof.ssa Giovanna Riccardi presso l'Università degli Studi di Pavia;
19/01/2015-14/04/2015: ospite del laboratorio del Prof. Miguel Valvano presso il Centre of Infection and Immunity, Queen's University of Belfast.

Riconoscimenti, premi e borse di studio

Vincitrice finanziamento da parte della SIMGBM per la partecipazione al Convegno FISV 2012, svoltosi a Roma dal 24 al 27 settembre 2012;
Vincitrice FEMS Young Scientist Meeting Grant (YSMG) per la partecipazione al convegno “Marine Microbiology and Biotechnology: Biodiscovery, Biodiversity and Bioremediation”, (Cork, Ireland, dal 14 al 16 novembre 2012);
Vincitrice finanziamento da parte della SIMGBM per la partecipazione al Convegno FISV 2014, svoltosi a Pisa dal 24 al 27 settembre 2014;
Vincitrice FEMS Short Term Fellowship, titolo del progetto: Supervisor: Prof. Miguel Valvano.
Vincitrice FEMS Congress Grant per la partecipazione al convegno 7^th FEMS Congress of European Microbiologists (Valencia, Spagna, 9-13 luglio 2017).
Vincitrice FEMS Congress Award per uno dei migliori lavori presentati al convegno 7^th FEMS Congress of European Microbiologists (Valencia, Spagna, 9-13 luglio 2017).
Vincitrice FEMS Meeting Attendance Grant per la partecipazione a IBCWG 2018 (Dublin, Irlanda, 2-5 Maggio 2018)
Vincitrice FEMS Congress Grant per la partecipazione al convegno 8^th FEMS Congress of European Microbiologists (Glasgow, 7-11 luglio 2019).

Vincitrice FEMS award per il miglior progetto presentato alla prima at first FEMS Summer School for Postdocs (Split, Croatia, 28 Agosto- 7 Settembre 2019)

Società

Membro della Società Italiana di Microbiologia Generale e Biotecnologie Microbiche (SIMGBM) dal 2011

Membro FEMS (Federation of European Microbiological Societies) dal 2011

Membro AGI (Associazione Genetica Italiana) da settembre 2022

Attività editoriale

Membro dell’Editorial Board della rivista BMC Genomics;
Associate Editor della rivista Frontiers in Genetics, Sezione Evolutionary and Genomic Microbiology;
Guest Associate Editor for Evolutionary and Genomic Microbiology per le riviste Frontiers in Genetics/ Frontiers in Microbiology. Titolo del research topic: “Evolution of genetic mechanisms of antibiotic resistance”;
Review Editor for System Biology per le riviste Frontiers;
Topic Editor della rivista Antibiotics (MDPI). Titolo dello special Issue: "Antibiotic Resistance Genes: Spread and Evolution" and "Antibiotics and Bacterial Metabolism"

Elena PERRIN

Pubblicazioni

Legenda

Contributo su rivista |

Articolo su libro |

Libro |

Contributo in atti di convegno (proceeding) |

Brevetto |

Curatela | Altro

Altro |

Tesi di Dottorato

Riccardi, Christopher; Calvanese, Marzia; Ghini, Veronica; Alonso-Vásquez, Tania; Perrin, Elena; Turano, Paola; Giurato, Giorgio; Weisz, Alessandro; Parrilli, Ermenegilda; Tutino, Maria Luisa; Fondi, Marco (2023). Metabolic Robustness to Growth Temperature of a Cold- Adapted Marine Bacterium. MSYSTEMS, vol. 8, pp. 0-0, ISSN:2379-5077 DOI

Alonso-Vásquez, Tania; Fondi, Marco; Perrin, Elena (2023). Understanding Antimicrobial Resistance Using Genome-Scale Metabolic Modeling. ANTIBIOTICS, vol. 12, pp. 0-0, ISSN:2079-6382 DOI

Riccardi, Christopher; Koper, Piotr; Innocenti, Gabriel; diCenzo, George C; Fondi, Marco; Mengoni, Alessio; Perrin, Elena (2023). Independent origins and evolution of the secondary replicons of the class Gammaproteobacteria. MICROBIAL GENOMICS, vol. 9, pp. 0-0, ISSN:2057-5858 DOI

Rizzo, Carmen; Perrin, Elena; Poli, Annarita; Finore, Ilaria; Fani, Renato; Lo Giudice, Angelina (2022). Characterization of the exopolymer-producing Pseudoalteromonas sp. S8-8 from Antarctic sediment. APPLIED MICROBIOLOGY AND BIOTECHNOLOGY, pp. 0-0, ISSN:0175-7598 DOI

Scoffone, Viola Camilla; Trespidi, Gabriele; Barbieri, Giulia; Irudal, Samuele; Perrin, Elena; Buroni, Silvia (2021). Role of RND Efflux Pumps in Drug Resistance of Cystic Fibrosis Pathogens. ANTIBIOTICS, vol. 10, pp. 863-887, ISSN:2079-6382 DOI

Daly G.; Perrin E.; Viti C.; Fondi M.; Adessi A. (2021). Scaling down the microbial loop: data-driven modelling of growth interactions in a diatom–bacterium co-culture. ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY REPORTS, vol. 6, pp. 945-954, ISSN:1758-2229 DOI

Fagorzi, Camilla; Bacci, Giovanni; Huang, Rui; Cangioli, Lisa; Checcucci, Alice; Fini, Margherita; Perrin, Elena; Natali, Chiara; diCenzo, George Colin; Mengoni, Alessio (2021). Nonadditive Transcriptomic Signatures of Genotype-by-Genotype Interactions during the Initiation of Plant-Rhizobium Symbiosis. MSYSTEMS, vol. 6, pp. 0-0, ISSN:2379-5077 DOI Accesso ONLINE all'editore

Daly G., Perrin E., Viti C., Fondi M., Adessi A (2021). Growth interactions in a diatom-bacterium co-culture: data-driven model supports experimental data. In: MD 2021, Advances in Microbial Diversity Virtual event, Virtual Event, 14-15 Dicembre 2021, SIMTREA, pp. 0-0.

Perrin E.; Ghini V.; Giovannini M.; Di Patti F.; Cardazzo B.; Carraro L.; Fagorzi C.; Turano P.; Fani R.; Fondi M. (2020). Diauxie and co-utilization of carbon sources can coexist during bacterial growth in nutritionally complex environments. NATURE COMMUNICATIONS, vol. 11, pp. 3135-3151, ISSN:2041-1723 DOI

Buroni S.; Pollini S.; Rossolini G.M.; Perrin E. (2019). Editorial: Evolution of Genetic Mechanisms of Antibiotic Resistance. FRONTIERS IN GENETICS, vol. 10, pp. 983-983, ISSN:1664-8021 DOI Accesso ONLINE all'editore

diCenzo, George C; Mengoni, Alessio; Perrin, Elena (2019). Chromids aid genome expansion and functional diversification in the family Burkholderiaceae. MOLECULAR BIOLOGY AND EVOLUTION, vol. msy248, pp. 0-0, ISSN:0737-4038 DOI Accesso ONLINE all'editore

Checcucci, Alice; diCenzo, George C.; Perrin, Elena; Bazzicalupo, Marco; Mengoni, Alessio (2019). Genomic Diversity and Evolution of Rhizobia. In: Surajit Das, Hirak Ranjan Dash. Microbial Diversity in the Genomic Era, pp. 37-46 Elsevier, ISBN:9780128148495. DOI Accesso ONLINE all'editore

Bacci G., Amalfitano S., Levantesi C., Rossetti S., Garrelly L., Canganella F., Bianconi G., Di Pilato V., Rossolini G.M., Mengoni A., Fani R., Perrin E. (2019). Microbial community composition of water samples stored inside the International Space Station. RESEARCH IN MICROBIOLOGY, vol. 170, pp. 230-234, ISSN:0923-2508 Accesso ONLINE all'editore

Gallo G., Presta L., Perrin E., Gallo M., Marchetto D., Puglia A.M., Fani R., Baldi F. (2018). Genomic traits of Klebsiella oxytoca DSM 29614, an uncommon metal-nanoparticle producer strain isolated from acid mine drainages. BMC MICROBIOLOGY, vol. 18, pp. 1-14, ISSN:1471-2180 Accesso ONLINE all'editore

Perrin, E.; Maggini, V.; Maida, I.; Gallo, E. R.; Lombardo, K.; Madarena, M. P.; Buroni, S.; Scoffone, V. C.; Firenzuoli, F.; Mengoni, A.; Fani, R. (2018). Antimicrobial activity of six essential oils against Burkholderia cepacia complex: insights into mechanism(s) of action. FUTURE MICROBIOLOGY, vol. 13, pp. 59-67, ISSN:1746-0913 DOI

Maggini V., Miceli E., Fagorzi C., Maida I., Fondi M., Perrin E., Mengoni A., Bogani P., Chiellini C., Mocali S., Fabiani A., Decorosi F., Giovannetti L., Firenzuoli F., Fani R. (2018). Antagonism and antibiotic resistance drive a species-specific plant microbiota differentiation in Echinacea spp.. FEMS MICROBIOLOGY ECOLOGY, vol. 94, pp. 1-11, ISSN:0168-6496 DOI Accesso ONLINE all'editore

Perrin, Elena; Bacci, Giovanni; Garrelly, Laurent; Canganella, Francesco; Bianconi, Giovanna; Fani, Renato; Mengoni, Alessio (2018). Furnishing spaceship environment: evaluation of bacterial biofilms on different materials used inside International Space Station. RESEARCH IN MICROBIOLOGY, pp. 0-0, ISSN:0923-2508 DOI Accesso ONLINE all'editore

Sannino, F.; Parrilli, E.; Apuzzo, G.A.; de Pascale, D.; Tedesco, P.; Maida, I.; Perrin, E.; Fondi, M.; Fani, R.; Marino, G.; Tutino, M.L. (2017). Pseudoalteromonas haloplanktis produces methylamine, a volatile compound active against Burkholderia cepacia complex strains. NEW BIOTECHNOLOGY, vol. 35, pp. 13-18, ISSN:1871-6784 Accesso ONLINE all'editore

Bosi, E.; Fondi, M.; Orlandini, V.; Perrin, E.; Maida, I.; de Pascale, D.; Tutino, M.L.; Parrilli, E.; Lo Giudice, A.; A, Filloux; Fani, R. (2017). The Pangenome of (Antarctic) Pseudoalteromonas bacteria: evolutionary and functional insights. BMC GENOMICS, vol. 18, pp. 93-110, ISSN:1471-2164 Accesso ONLINE all'editore

Chiellini, Carolina; Maida, Isabel; Maggini, Valentina; Bosi, Emanuele; Mocali, Stefano; Emiliani, Giovanni; Perrin, Elena; Firenzuoli, Fabio; Mengoni, Alessio; Fani, Renato (2017). Preliminary data on antibacterial activity of Echinacea purpurea-associated bacterial communities against Burkholderia cepacia complex strains, opportunistic pathogens of Cystic Fibrosis patients. MICROBIOLOGICAL RESEARCH, vol. 196, pp. 34-43, ISSN:0944-5013

Presta, L.; Bosi, E.; Fondi, M.; Maida, I.; Perrin, E.; Miceli, E.; Maggini, V.; Bogani, P.; Firenzuoli, F.; Di Pilato, V.; Rossolini, G.M.; Mengoni, A.; Fani, R. (2017). Phenotypic and genomic characterization of the antimicrobial producer Rheinheimera sp. EpRS3 isolated from the medicinal plant Echinacea purpurea: insights into its biotechnological relevance. RESEARCH IN MICROBIOLOGY, vol. 168, pp. 293-305, ISSN:0923-2508 Accesso ONLINE all'editore

Maggini, V.; Presta, L.; Miceli, E.; Fondi, M.; Bosi, E.; Chiellini, C.; Fagorzi, C.; Bogani, P.; Di Pilato, V.; Rossolini, G.M.; Mengoni, A.; Firenzuoli, F.; Perrin, E.; Fani, R. (2017). Draft Genome Sequence of Pseudomonas sp. Strain Ep R1 Isolated from Echinacea purpurea Roots and Effective in the Growth Inhibition of Human Opportunistic Pathogens Belonging tothe Burkholderia cepacia Complex. GENOME ANNOUNCEMENTS, vol. 5, pp. 1-2, ISSN:2169-8287 Accesso ONLINE all'editore

Miceli, E.; Presta l:, Maggini V.; Fondi, M.; Bosi, E.; Chiellini, C.; Fagorzi, C.; Bogani, P.; Di Pilato, V.; Rossolini, G.M.; Mengoni, A.; Firenzuoli, F.; Perrin, E.; Fani, R. (2017). New Genome Sequence of an Echinacea purpurea Endophyte, Arthrobacter sp. Strain EpSL27, Able To Inhibit Human-Opportunistic Pathogens.. GENOME ANNOUNCEMENTS, vol. xxx5, pp. 1-2, ISSN:2169-8287 Accesso ONLINE all'editore

Perrin, E.; Fondi, M.; Bosi, E.; Mengoni, A.; Buroni, S.; Scoffone, V. C.; Valvano, M.; Fani, R. (2017). Subfunctionalization influences the expansion of bacterial multidrug antibiotic resistance. BMC GENOMICS, vol. 18, pp. 834-847, ISSN:1471-2164 Accesso ONLINE all'editore

Mocali, S.; Chiellini, C.; Fabiani, ; A, .; Decuzzi, S; de Pascale, D.; Parrilli, E.; Tutino, M. L.; Perrin, E.; Bosi, E.; Fondi, M.; Lo Giudice, A.; Fani, R. (2017). Ecology of cold environments: new insights of bacterial metabolic adaptation through an integrated genomic-phenomic approach. SCIENTIFIC REPORTS, vol. 7, pp. 839-851, ISSN:2045-2322 Accesso ONLINE all'editore

Maggini, Valentina; Pesavento, Giovanna; Maida, Isabel; LO NOSTRO, Antonella; Calonico, Carmela; Sassoli, Chiara; Perrin, Elena; Fondi, Marco; Mengoni, Alessio; Chiellini, Carolina; Vannacci, Alfredo; Gallo, EUGENIA ROSARIA; Gori, Luigi; Bogani, Patrizia; Bilia, A. R.; Campana, Silvia; Ravenni, N.; Dolce, Daniela; Firenzuoli, Fabio; Fani, Renato (2017). Exploring the Effect of the Composition of Three Different Oregano Essential Oils on the Growth of MultiDrug-Resistant Cystic Fibrosis Pseudomonas aeruginosa Strains. NATURAL PRODUCT COMMUNICATIONS, vol. 12, pp. 1949-1952, ISSN:1555-9475

Presta, L.; Bosi, E.; Fondi, M.; Maida, I.; Perrin, E.; Miceli, E.; Maggini, V.; Bogani, P.; Firenzuoli, F.; Di Pilato, V.; Rossolini, G.M.; Mengoni, A.; Fani, R. (2016). Draft Genome Announcement of Pseudomonas sp. EpS/L25 isolated from the medicinal plant Echinacea pupurea and able to synthesize antimicrobial compounds. GENOME ANNOUNCEMENTS, pp. 1-2, ISSN:2169-8287

Presta, Luana; Bosi, Emanuele; Fondi, Marco; Maida, Isabel; Perrin, Elena; Miceli, Elisangela; Maggini, Valentina; Bogani, Patrizia; Firenzuoli, Fabio; DI PILATO, Vincenzo; Rossolini, GIAN MARIA; Mengoni, Alessio; Fani, Renato (2016). Draft Genome Sequence of Pseudomonas sp. EpS/L25, Isolated from the Medicinal Plant Echinacea purpurea and Able To Synthesize Antimicrobial Compounds. GENOME ANNOUNCEMENTS, vol. 4, pp. 1-2, ISSN:2169-8287 DOI

Presta, L; Inzucchi, L; Bosi, E; Fondi, M; Perrin, E; Miceli, E; Tutino, Ml; Lo Giudice, A; de Pascale, D; Fani, R (2016). Draft genome sequence of Flavobacterium sp. Strain TAB 87 able to inhibit the growth of Cystic Fibrosis bacterial pathogens belonging to the Burkholderia cepacia complex. GENOME ANNOUNCEMENTS, pp. 16-17, ISSN:2169-8287 Accesso ONLINE all'editore

Fondi, Marco; Maida, Isabel; Perrin, Elena; Orlandini, Valerio; Torre, Laura La; Bosi, Emanuele; Negroni, Andrea; Zanaroli, Giulio; Fava, Fabio; Decorosi, Francesca; Giovannetti, Luciana; Viti, Carlo; Vaneechoutte, Mario; Dijkshoorn, Lenie; Fani, Renato (2016). Genomic and phenotypic characterization of the species Acinetobacter venetianus. SCIENTIFIC REPORTS, vol. 6, pp. 1-12, ISSN:2045-2322 DOI Accesso ONLINE all'editore

Pesavento, G; Maida, I; Lo Nostro, A; Calonico, C; Sassoli, C; Perrin, E; Fondi, M; Mengoni, A; Chiellini, C; Maggini, V; Vannacci, A; Gallo, E; Gori, L; Bogani, P; Bilia, Ar; Campana, S; Ravenni, N; Dolce, D; Firenzuoli, F; Fani, R (2016). Essential oil from Origanum vulgare completely inhibits the growth of multidrug-resistant Cystic Fibrosis pathogens. NATURAL PRODUCT COMMUNICATIONS, vol. 11, pp. 861-864, ISSN:1555-9475

Presta, L.; Fondi, M.; Perrin, E.; Maida, I; Miceli, E.; Chiellini, C.; Maggini, V.; Bogani, P.; Di Pilato, V.; Rossolini, G.M.; Mengoni, A.; Fani, R. (2016). Arthrobacter sp. EpRS66 and Arthrobacter sp. EpRS71: draft genome sequences from two bacteria isolated from Echinacea purpurea rhizospheric soil. FRONTIERS IN MICROBIOLOGY, vol. 7, pp. 1417-1419, ISSN:1664-302X DOI Accesso ONLINE all'editore

Tedesco, Pietro; Visone, Marco; Parrilli, Ermenegilda; Tutino, Maria Luisa; Perrin, Elena; Maida, Isabel; Fani, Renato; Ballestriero, Francesco; Santos, Radleigh; Pinilla, Clemencia; Schiavi, Elia Di; Tegos, George; de Pascale, Donatella (2015). Investigating the Role of the Host Multidrug Resistance Associated Protein Transporter Family in Burkholderia cepacia Complex Pathogenicity Using a Caenorhabditis elegans Infection Model. PLOS ONE, vol. 10, pp. 1-17, ISSN:1932-6203

Perrin, Elena; Fondi, Marco; Maida, Isabel; Mengoni, Alessio; Chiellini, Carolina; Mocali, Stefano; Cocchi, Priscilla; Campana, Silvia; Taccetti, Giovanni; Vaneechoutte, Mario; Fani, Renato (2015). Genomes analysis and bacteria identification: The use of overlapping genes as molecular markers. JOURNAL OF MICROBIOLOGICAL METHODS, vol. 117, pp. 108-112, ISSN:0167-7012 DOI Accesso ONLINE all'editore

M. Fondi; I. Maida; E. Perrin; A. Mellera; S. Mocali; E. Parrilli; M. L. Tutino; P. Liò; R. Fani (2015). Genome scale metabolic reconstruction and constraints-based modelling of the Antarctic strain Pseudoalteromonas haloplanktis TAC125. ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY, vol. 17, pp. 751-766, ISSN:1462-2920 Accesso ONLINE all'editore

M.C. Papaleo; M. Fondi; I. Maida; E. Perrin; A. Bevivino; C. Dalmastri; R. Fani (2015). Analysis of a pool of small plasmids from soil heterotrophic cultivable bacterial communities. THE OPEN MICROBIOLOGY JOURNAL, vol. 9, pp. 98-109, ISSN:1874-2858

Bosi, Emanuele; Fondi, Marco; Maida, Isabel; Perrin, Elena; Pascale, Donatella de; Tutino, Maria Luisa; Parrilli, Ermenegilda; Giudice, Angelina Lo; Filloux, Alain; Fani, Renato (2015). Genome-scale phylogenetic and DNA composition analyses of Antarctic Pseudoalteromonas bacteria reveal inconsistencies in current taxonomic affiliation. HYDROBIOLOGIA, vol. 761, pp. 85-95, ISSN:0018-8158 Accesso ONLINE all'editore

I. Maida; E. Bosi; M. Fondi; E. Perrin; V. Orlandini; M. C.Papaleo; A. Mengoni; D. de Pascale; M. L. Tutino; L. Michaud; A. Lo Giudice; R. Fani (2015). Antimicrobial activity of Pseudoalteromonas strains isolated from the Ross Sea (Antarctica) vs Cystic Fibrosis opportunistic pathogens. HYDROBIOLOGIA, vol. 761, pp. 443-457, ISSN:0018-8158 Accesso ONLINE all'editore

I. Maida; M. Fondi; M.C. Papaleo; E. Perrin; V. Orlandini; G. Emiliani; D. de Pascale; E. Parrilli; M.L. Tutino; L. Michaud; A. Lo Giudice; R. Romoli; G. Bartolucci; R. Fani (2014). Phenotypic and genomic characterization of the Antarctic bacterium Gillisia sp. CAL575, a producer of antimicrobial compounds. EXTREMOPHILES, vol. 18, pp. 35-49, ISSN:1431-0651 DOI Accesso ONLINE all'editore

Elena Perrin (2014). Fighting Burkholderia cepacia complex: exploring virulence, new antimicrobials and antibiotics resistance. (Tutor: Prof. Renato Fani)

I. Maida; M. Fondi; V. Orlandini; G. Emiliani; M. C. Papaleo; E. Perrin; R. Fani (2014). Origin, duplication and reshuffling of plasmid genes: insights from Burkholderia vietnamiensis G4 genome. GENOMICS, vol. 103, pp. 229-238, ISSN:0888-7543

V. Orlandini; I. Maida; M. Fondi; E. Perrin; M.C. Papaleo; E. Bosi; D. de Pascale; M.L. Tutino; L. Michaud; A. Lo Giudice; R. Fani (2014). Genomic analysis of three sponge-associated Arthrobacter Antarctic strains, inhibiting the growth of Burkholderia cepacia complex bacteria by synthesizing volatile organic compounds. MICROBIOLOGICAL RESEARCH, vol. 169, pp. 593-601, ISSN:0944-5013

V. Orlandini; G. Emiliani; M. Fondi; I. Maida; E. Perrin; R. Fani (2014). Network analysis of plasmidomes: the Azospirillum brasilense Sp245 case. INTERNATIONAL JOURNAL OF EVOLUTIONARY BIOLOGY, vol. 2014, pp. 1-14, ISSN:2090-052X

G. Emiliani; A. Mengoni; I. Maida; E. Perrin; C. Chiellini; M. Fondi; E. Gallo; L. Gori; V. Maggini; A. Vannacci; S. Biffi; F. Firenzuoli; R. Fani (2014). Linking bacterial endophytic communities to essential oils: clues from Lavandula angustifolia Mill.. EVIDENCE-BASED COMPLEMENTARY AND ALTERNATIVE MEDICINE, vol. 2014, pp. 1-16, ISSN:1741-427X Accesso ONLINE all'editore

M. Fondi; V. Orlandini; E. Perrin; I. Maida; E. Bosi; M.C. Papaleo; L. Michaud; A. Lo Giudice; D. de Pascale; M.L. Tutino; P. Liò; R. Fani (2014). Draft genomes of three Antarctic Psychrobacter strains producing antimicrobial compounds against Burkholderia cepacia complex, opportunistic human pathogens. MARINE GENOMICS, vol. 13, pp. 37-38, ISSN:1874-7787

E. Perrin; M. Fondi; I. Maida; V. Orlandini; E. Bosi; A. Mengoni; M. Galardini; P. Vandamme; F. Decorosi; C. Viti; L. Giovannetti; S. Buroni; G. Riccardi; R. Alduina; G. Gallo; A.M. Puglia; A. Fiore; G. Giuliano; R. Fani (2014). From Genome to phenome and back: understanding the high metabolic versatility of Burkholderia cepacia complex. In: Internationa Burkholderia cepacia working group,18th Annual meeting, Nimes, France, IBCWG, pp. 24-24.

I. Maida; A. Lo Nostro; G. Pesavento; M. Barnabei; C. Calonico; E. Perrin; C. Chiellini; M. Fondi; A. Mengoni; V. Maggini; A. Vannacci; E. Gallo; A.R. Bilia; G. Flamini; L. Gori; F. Firenzuoli; R. Fani (2014). Exploring the anti-Burkholderia cepacia complex activity of essential oils: a preliminary analysis. EVIDENCE-BASED COMPLEMENTARY AND ALTERNATIVE MEDICINE, vol. 2014, pp. 1-10, ISSN:1741-4288 DOI

G. Emiliani; G. Bianconi; E. Di Mattia; F. Canganella; A. Fabiani; S. Mocali; I. Maida; E. Perrin; M. Fondi; R. Fani (2013). Isolation and Molecular characterization of planktonic and epilithic bacterial communities from the iron-rich river Acquarossa. In: FEMS 2013, Leipzig, Germany, 21-25 luglio, Kenes, pp. PO02-PO02. Accesso ONLINE all'editore

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M. Fondi; G. Emiliani; E. Rizzi; G. Corti; M.C. Papaleo; E. Perrin; I. Maida; F. Baldi; M. Vaneechoutte; L. Dijkshoorn; G. De Bellis; R. Fani (2010). The genome of the hydrocarbon-degrading bacterium Acinetobacter venetianus VE-C3. In: Acinetobacter 2010, Roma (Italia), Settembre, pp. 67-67.

M. Fondi; G. Emiliani; E. Rizzi; G. Corti; M.C. Papaleo; E. Perrin; I. Maida; F. Baldi; G. De Bellis; R. Fani (2010). The genome and the evolution of the hydrocarbon-degrading bacterium Acinetobacter venetianus VE-C3. In: IV Convegno S.I.B.E., Milano (Italia), Settembre, pp. 71-71.

M. Fondi; G. Emiliani; I. Maida; E. Perrin; M.C. Papaleo; R. Fani (2010). The origin and evolution of nif genes: the piecemeal assembly of nitrogen fixation. In: 9th european Nitrogen Fixation Conference, Geneva (Svizzera), Settembre, pp. 35-35.

M. Fondi; I. Maida; E. Perrin; M.C. Papaleo; G. Emiliani; R. Fani (2010). On the origin and evolution of nitrogen fixation genes. In: 3rd Workshop of the Italian Astrobiology Society, Duino (Italia), Maggio, vol. When Darwin meets Copernicus, pp. 44-45.

M.C. Papaleo; M. Fondi; I. Maida; B. Tarabella; E. Perrin; A. LoGiudice; L. Michaud; S. Mangano; V. Bruni; R. Fani (2009). Potential novel antibiotics from antarctic bacteria against human pathogens. In: Bageco 10, Uppsala (Svezia), Giugno, pp. 283-283.

I. Maida; E. Perrin; M.C. Papaleo; R. Fani; M. Fondi (2009). The Acinetobacter pan-plasmidome: insights into ecological adaptations. In: Prokagenomics 2009, Gottingen (Germania), Ottobre, pp. P61-P61.

E. Perrin; I. Maida; M.C. Papaleo; M. Fondi; R. Fani (2009). Comparative genomics of Burkholderia genus: insights in the adaptation to a patogenic lifestyle. In: 28th National Meeting - SIMGBM, Spoleto (Italia), Giugno, pp. 190-190.

S. Mocali; C. Galeffi; A. Florio; M. Migliore; F. Canganella; G. Bianconi; E. Di Mattia; E. Perrin; R. Fani; A. Benedetti (2009). Electricity generation of bacterial communities using microbial fuel cells. In: 11° Convegno FISV, Riva del Garda (Italia), Settembre, pp. D14.02-D14.02.

I. Maida; E. Perrin; M.C. Papaleo; G. Emiliani; R. Fani; M. Fondi (2009). Comparative genomics of the genus Burkholderia: insights into pathogens evolution. In: Sixth Annual Meeting Bioinformatics Italian Society, Genova (Italia), Marzo, pp. 86-87.

M. Fondi; M.C. Papaleo; G. Emiliani; E. Perrin; I. Maida; R. Fani (2009). The primordial metabolism: the origin and evolution of metabolic pathway. In: 28th National Meeting- SIMGBM, Spoleto (Italia), Giugno, pp. 33-33.

E. Perrin; I. Maida; M.C. Papaleo; R. Fani; M. Fondi; (2009). In silico comparative analysis of antibiotics RND-efflux pumps in Burkholderia genus. In: Sixth Annual Meeting Bioinformatics Italian Society, Genova (Italia), Marzo, pp. 131-132.

I. Maida; E. Perrin; M.C. Papaleo; M. Fondi ; R. Fani (2009). Comparative genomics analysis of Burkholderia genus: insights in the adaptation to a pathogenic lifestye. In: Bageco 10, Upssala (Svezia), Giugno, pp. 153-153.

M.C. papaleo; E. Perrin; I. Maida; B. Tarabella; M. Fondi; R. Fani (2008). Identification of Burkholderia cepacia complex species by SNuPE and LAMP analysis of histidine biosynthetic genes. JOURNAL OF CYSTIC FIBROSIS, vol. 7, Supplement 2, pp. S41-S41, ISSN:1569-1993

M.C. Papaleo; E. Perrin; I. Maida; E. Russo; E. Brenci; B. Tarabella; R. Fani (2007). A two-stage strategy for early and accurate detection of B. cepacia in routine clinical analysis involving CF patients. Identification of Burkholderia cepacia strains by LAMP and SNuPE. In: 5a Convention d’autunno dei ricercatori italiani per la Fibrosi Cistica, Verona (Italia), Ottobre, pp. 31-32.

M.C. Papaleo; E. Russo; E. Perrin; M. Brilli; M. Fondi; A. Frandi; R. Fani (2007). Identification of Burkholderia cepacia complex species by LAMP or SNuPE analysis of his genes. In: 9° Convegno FISV, Riva del Garda (Italia), Settembre, pp. PMS.8-P35-PMS.8-P35.

M. C. Papaleo; E. Russo; E. Perrin; R. Fani (2007). Identification of Burkholderia cepacia complex species by Loop Mediated Isothermal Amplification (LAMP) or Single Nucleotide Primer Extension (SNuPE) analysis of his genes. In: BMMA 2007, Bertinoro (Italia), Maggio, pp. 16-16.

M.C. Papaleo; E. Russo; I. Maida; L. Ferri; E. Perrin; M. Fondi; M. Brilli; R. Fani (2006). Structural, functional and evolutionary analysis of histidine biosynthetic genes in Burkholderia strains. In: I Congresso S.I.B.E., Firenze (Italia), Settembre, pp. 174-175.

Elena PERRIN

Curriculum

Elena Perrin

Curriculum vitae et studiorum

PERSONAL INFORMATION

Date of birth: 30/04/1984

Nationality: Italian

Office address: Department of Biology, University of Florence, via Madonna del Piano 6, 50019 Sesto Fiorentino (FI)

Actual position: researcher Law 240/10 typology A, SSD: BIO/18

EDUCATION AND WORK EXPERIENCE

September 2022 - present: researcher Law 240/10 typology A, SSD: BIO/18
May 2015- August 2022: Post-doc researcher at the Department of Biology, University of Florence
January- April 2015

FEMS Research Grant at the Centre for Infection and Immunity, Queen's University of Belfast, with the supervision of Prof. Miguel Valvano.

January- December 2014

Post- Doc fellowship of the Foundation "Adriano Buzzati-Traverso" for a project entitled "Fighting Burkholderia infections through the understanding of RND proteins regulation".

March 2014

PhD in "Plant, microbiological and genetic science and technology " (specializing in " Genetic and Microbiology and Bioinformatics sciences") at the University of Florence with a thesis entitled "Fighting Burkholderia cepacia complex: exploring virulence, new antimicrobials and antibiotics resistance".

January 2011- December 2013

PhD student in “SCIENZE E TECNOLOGIE VEGETALI, MICROBICHE E GENETICHE”, PhD school “Ubaldo Montelatici”, University of Florence.

July- December 2010

Fellowship at the Department of Evolutionary Biology “Leo Pardi”, University of Florence, for the “Characterization of natural microbial communities isolated from soils subjected to different agricultural practices”.

December 2009

Qualifying examination for Biologists at University of Florence

Final Mark: 200/200

October- December 2009

Fellowship at the Department of Evolutionary Biology “Leo Pardi”, University of Florence, for the “Identification of genes of opportunistic pathogens responsible for infections in patients with cystic fibrosis to be used as a target of antibiotics produced by bacteria Antarctic”.

Academic year 2007-2008

Degree in “Cellular and Molecular Biology” with a thesis entitled:

“Evolutionary and comparative analisys of RND efflux systems in the Burkholderia genus”

Final Mark: 110/110 cum laude

September 2008- April 2009

Thesis internship at the Laboratory of Microbial and Molecular Evolution, Department of Evolutionary Biology “Leo Pardi”, University of Florence (supervisor: Prof. Renato Fani).

Academic year 2006-2007

Matriculation at the course of degree in “Cellular and Molecular Biology”, at University of Florence

Academic year 2005-2006

Degree in “Biology Science” with a thesis entitled:

“SNuPE (Single Nucleotide Primer Extension) : a new molecular methods for the identification of bacteria”

Final Mark: 110/110 cum laude

July 2006-January 2007

Thesis internship at the Laboratory of Microbial and Molecular Evolution, Department of Evolutionary Biology “Leo Pardi”, University of Florence (supervisor: Prof. Renato Fani).

Academic year 2003-2004

Matriculation at the course of degree in “Biology Science”, at University of Florence

School year 2002-2003

High School degree at Liceo Scientifico e Liceo Ginnasio “Benedetto Varchi” (Montevarchi (AR))

Final mark: 100

AWARDS

FEMS Young Scientist Meeting Grant (YSMG) for the conference “Marine Microbiology and Biotechnology: Biodiscovery, Biodiversity and Bioremediation”, (Cork, Ireland, 14_16 November 2012);
FEMS Short Term Fellowship 2015, Supervisor: Prof. Miguel Valvano.
FEMS Congress Grant for the conference 7^th FEMS Congress of European Microbiologists (Valencia, Spain, 9-13 July 2017).
FEMS Congress Award for one of the best paper presented at the 7th FEMS Congress of European Microbiologists (Valencia, Spain, 9-13 July 2017).
FEMS Meeting Attendance Grant for IBCWG 2018 (Dublin, Ireland, 2-5 may 2018)
FEMS Congress Grant for the conference 8^th FEMS Congress of European Microbiologists (Glasgow, UK, 7-11 July 2019).
FEMS award for the best presented project at first FEMS Summer School for Postdocs (Split, Croatia, August 28^th-September 7^th 2019)

SOCIETY

Member of the Italian Society of General Microbiology and Microbial Biotechnology (SIMGBM) from 2011

FEMS Member from 2011

AGI member from 2022

EDITORIAL ACTIVITY

Member of the editorial board di BMC genomics

Guest Associate Editor for Evolutionary and Genomic Microbiology section of Frontiers in Genetics and Frontiers in Microbiology

Review Editor for “Systems Biology” of Frontiers journal

Topic Editor for the Antibiotics journal (MDPI)

Elena PERRIN

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Insegnamenti relativi all'Anno Accademico 2023-2024 2022-2023 2021-2022 2020-2021 2019-2020

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Insegnamenti relativi all'Anno Accademico